Électrophorèse sur gel en gradient dénaturant

L'électrophorèse sur gel en gradient dénaturant ou DGGE est une technique d'électrophorèse donnant la possibilité de la séparation de molécules d'acides nucléiques de même taille.

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L'électrophorèse sur gel en gradient dénaturant ou DGGE (acronyme de l'anglais denaturing gradient gel electrophoresis) est une technique d'électrophorèse donnant la possibilité de la séparation de molécules d'acides nucléiques (ADN ou ARN) de même taille. Son principe consiste à déposer un échantillon d'acide nucléique sur un gel d'électrophorèse contenant un agent dénaturant (par exemple l'urée). Dans un gel DGGE, les fragments d'acide nucléique sont soumis à différentes concentrations du dénaturants. Quand la température de fusion ou Tm (Tm : melting température) du fragment est atteinte, il se dénature partiellement, ce qui stoppe sa migration (Ercolini, 2004).

Applications

Analyse de la diversité du gène de l'ARN ribosomique (16S ou 18S) de populations microbiennes naturelles (sol, milieux aquatiques) ^[1].

diagnostic direct des maladies génétiques

Bibliographie

Ercolini, D., 2004. PCR-DGGE fingerprinting : novel strategies for detection of microbes in food. J Microbiol Methods. 56 (3) :297-314. Review. PMID : 14967221 [PubMed - indexed for MEDLINE]

Références

Muyzer, G. 1999. DGGE/TGGE a method for identifying genes from natural ecosystems. Current opinion in Microbiology 2 : 317-22.

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